小长蝽线粒体基因组全序列测定与长蝽总科系统发育分析

Journal of Environmental Entomology(2023)

引用 0|浏览14
暂无评分
摘要
为了解小长蝽Nysius ericae(Schilling)线粒体基因组结构及长蝽总科的分子系统发育关系.本试验采用Illumina MiSeq测序平台对小长蝽线粒体基因进行测序,对基因组序列进行拼装、注释和特征分析,利用最大似然法和贝叶斯法构建基于12 种长蝽总科昆虫线粒体全基因组核苷酸序列的系统发育树.小长蝽线粒体基因组全长为16330 bp(GenBank登录号:MW465654),基因组包括13 个蛋白编码基因(PCGs),22 个tRNA基因,2 个rRNA基因和1 段非编码控制区.11 个蛋白质编码基因的起始密码子为典型的ATN;cox1,nad4l的起始密码子为TTG.cob的终止密码子为TAG,其余蛋白编码基因的终止密码子为TAA.只有trnS1 缺少DHU臂,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构.12 种长蝽总科昆虫线粒体全基因组序列构建的昆虫系统发育树结果显示,小长蝽与Nysius plebeius具有更近的亲缘关系,且与传统形态学分类基本一致.小长蝽线粒体基因组符合长蝽总科线粒体基因组的一般特征.结果表明小长蝽与N.plebeius的亲缘关系更近.
更多
查看译文
关键词
Nysius ericae,Hemiptera,Orsillinae,mitochondrial genome,phylogeny
AI 理解论文
溯源树
样例
生成溯源树,研究论文发展脉络
Chat Paper
正在生成论文摘要