侵染假酸浆的泰国番茄黄化曲叶病毒全基因组结构特征

为明确假酸浆Nicandra physalodes叶片黄化、皱缩症状是否由菜豆金色花叶病毒属病毒侵染引起,本研究利用分子检测方法和生物信息学技术鉴定了假酸浆样品中的病毒种类.从采集的病样中克隆并获得了 2条菜豆金色花叶病毒属病毒DNA-A全序列和1条beta卫星全序列,经全序列分析发现,该双生病毒的两条DNA-A全序列与泰国番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl Thailand virus,TYLCTHV)云南分离物 TYLCTHV-YN1732 一致性最高,达99.3％,亲缘关系较近;beta卫星的全序列与云南番茄曲叶beta卫星(tomato leaf curl Yunnan betasatellite,TLCYnB)的分离物YN5230 一致性最高,达99.3％,亲缘关系较近.重组分析显示,假酸浆上分离的TYLCTHV-YN5735-12是一个重组病毒,有两个重组事件,一个主要发生在AV1的编码区,由中国番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV)和广西大戟曲叶病毒(euphorbia leaf curl Guangxi virus,Eu-LCGXV)重组形成,另一个重组事件主要发生在基因间隔区(IR区),由泰国烟草卷叶病毒(tobacco leaf curl Thai-land virus,TbLCTHV)和TYLCTHV重组形成.研究结果表明,假酸浆是TYLCTHV的新寄主,这是单组分菜豆金色花叶病毒属病毒及其伴随beta卫星侵染假酸浆的首次报道.