辽宁地区5株H1N1亚型猪流感病毒分子特征与遗传进化分析

研究旨在了解辽宁地区猪群中猪流感病毒(SIV)的分子特征及遗传进化规律,探究其特异性分子靶标,为猪流感的防控提供参考.试验收集辽宁不同地区分离到的5株SIV,对其进行全基因组测序分析.利用DNAStar、MEGA6.0等软件对测序基因片段进行开放阅读框(ORF)核苷酸同源性分析,并构建遗传系统进化树.结果显示,5个分离株属于类禽型H1N1 SIV株,各基因同源性分别为HA 95.4％～99.7％、NA 97.3％～99.8％、M 92.6％～99.8％、NP 97.3％～99.1％、NS 96.1％～98.1％、PA 97.7％～99.3％、PB197.1％～99.8％和PB296.8％～99.2％.在8个基因片段中,HA、NA和NS基因均属类禽型H1N1进化分支,PB2、PB1、PA、NP基因属于人H1N1流感进化分支,M基因分属类禽H1N1 SIV分支和人H1N1流感分支,而NS基因属于经典型H1N1 SIV分支.研究表明,流行于辽宁地区SIV毒株中出现不同基因型流感病毒片段之间的重组情况,分离株HA蛋白裂解位点序列为PSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子特征.