石榴品种SSR指纹图谱构建及杂种父本鉴定

Acta Horticulturae Sinica(2023)

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摘要
以枣庄市石榴国家林木种质资源库中收集的168个石榴品种为材料,利用SSR分子标记技术构建了石榴品种资源指纹图谱,并基于指纹图谱信息,应用最大似然值法(LOD)对品种'秋艳'和'会理青皮软籽'的自然授粉实生苗进行了杂种筛选及父本初步鉴定.22对SSR引物从168个石榴品种样品中共扩增到76个等位标记位点,其中多态性位点58个,多态性为76.3%.平均等位位点数(Na)、有效等位位点数(Ne)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)分别为3.455、2.269、0.362、0.538,Shannon's信息指数(I)平均值为0.897,多态性信息含量(PIC)介于0.330~0.692之间,平均PIC值为0.462.利用22对SSR引物可将166个石榴品种区分开,另有'大满天红甜'和'小满天红甜'2个品种未有效区分,有同物异名的可能;在此基础上构建了 166个品种的特异指纹代码及指纹图谱二维码.基于指纹图谱信息,利用SSR标记从'秋艳'的30个自然授粉子代实生苗中筛选到1个真杂种Q-1,疑似父本为'嶧城丰产马牙',LOD值为5.96;从'会理青皮软籽'的118个自然授粉子代实生苗中筛选到6个真杂种H-4、H-49、H-51、H-87、H-94和H-103,疑似父本分别为'四川黄皮酸''突尼斯软籽''蒙自红花白皮''四川黄皮酸''突尼斯软籽'及'蒙自红花白皮'.
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关键词
Punica granatum,cultivar resource,SSR fingerprint,genetic diversity,male parent identification
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