基于单细胞组学分析LCLAT1在喉鳞癌中的表达及其与预后的关系

Modern Practical Medicine(2023)

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Abstract
目的 探讨心磷脂酰基转移酶1(LCLAT1)在喉鳞癌中的表达及其与预后的关系.方法 对3例喉鳞癌患者的肿瘤、癌旁及淋巴转移组织进行单细胞RNA测序.使用R软件对上述样本进行数据分析,观察LCLAT1在上皮细胞亚群中的表达情况.然后使用癌症基因组图谱(TCGA)中喉鳞癌的数据,分析了包含LCLAT1在内128个甘油磷脂合成途径相关基因的表达情况及对预后的影响,并使用Cytoscape软件评估了 LCLAT1在喉鳞癌甘油磷脂合成途径中的重要作用.最后使用免疫组化实验检测LCLAT1在20例喉鳞癌标本中的表达情况.结果 识别出10个主要的细胞簇,其中上皮细胞包含11个亚群,标记为c0~c10.簇c1是处在高增殖状态的恶性细胞,并且高表达LCLAT1.LCLAT1作为甘油磷脂合成途径中的关键基因之一在肿瘤组织中高表达,并且是喉鳞癌的危险因素和独立预后指标.免疫组化验证LCLAT1在喉鳞癌肿瘤组织中表达量高于癌旁组织.结论 LCLAT1在喉鳞癌高增殖状态的恶性上皮细胞中高表达,可能作为甘油磷脂合成途径中的关键基因促进喉癌发展,影响喉癌预后.
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