一株蝙蝠轮状病毒的分离和基因组分析

目的 了解云南地区蝙蝠轮状病毒的基因组特征和进化关系,并分离病毒.方法 采集84只云南地区蝙蝠,经解剖后收集肠道组织,混合为3个样本库后进行高通量测序.病毒全基因组扩增采用RT-PCR和RACE方法,使用RVA自动分型工具进行分型.采用MA104细胞分离培养病毒株.结果 高通量测序结果显示1个样本库中存在A组轮状病毒相关的序列.随后成功分离该蝙蝠轮状病毒并扩增获得全长或接近全长的11条基因组序列.基因组分型结果显示该病毒株属于G3-P[3]-18-R3-C3-M3-A9-N3-T3-E3-H6基因型,命名为CHYNC82.序列分析表明,CHYNC82的4条基因片段(VP1、NSP2、NSP3和NSP4)与蝙蝠病毒株MYAS33和MSLH14亲缘关系近且进化树聚为一支;VP2与人09US7118株和猿猴TUCH株进化距离最近,处于同一进化树枝;VP6和NSP1与已知病毒同源性较低,但与蝙蝠和人来源轮状病毒具有共同进化起源;而剩余4条基因片段(VP7、VP4、VP3和NSP5)与人类病毒株包括CMH222株和MS2015-1-0001株具有最高同源性,且处于同一进化树枝.结论 推测CHYNC82是经人、猿猴和蝙蝠来源的病毒株跨种属传播产生的重配RVA株,有机会性跨种传播感染人类的可能.