高通量测序技术筛选铝矿区认知障碍老年人群外周血circRNAs的差异表达谱及分析

wf(2023)

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摘要
目的 通过高通量测序技术筛选铝致认知障碍人群和正常人血液中差异表达的环状RNA(circRNA),以探讨circRNA在铝致认知障碍中的作用.方法 运用简易智力状态检查量表(mimi-mental state examination,MMSE)判断铝矿区老年人群认知水平,采集血液并测定血铝含量,选取高血铝水平认知正常人群为对照组(NC组),高血铝水平认知功能障碍人群为实验组(CI组),基于高通量测序技术获得差异表达的circRNA,运用生物信息学方法对上调最显著的circRNA可能结合的微小RNA(miRNA)及其可能参与铝致认知障碍的调控通路进行预估.结果 研究人员共收集十二个老年人的血液样品,其中3例高血铝认知正常,3例高血铝认知障碍,共筛查出差异表达的circRNA 539个,其中在CI组上调最突出的四种circRNA,依次为novel_circ_000349、novel_circ_004316、novel_circ_011663、novel_circ_017724,对其中结合匹配值最高的16个miRNA家族位点进行了分析,GO分析显示这些靶基因与转录调控、神经元的生长发育及神经系统的发展相关,KEGG分析表明其与多条认知功能障碍通路有关.结论 本研究筛选到的circRNA以及与之结合的miRNA可能与铝致认知障碍的发生发展相关,可以此为靶点进行后续相关的研究,并为铝致认知障碍发病机制提供基础信息.
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