影响人胰岛存活的关键基因及靶向保护方法探讨

目的 探讨影响人胰岛存活的关键基因及靶向保护方法.方法 采用生物信息学方法,在基因表达综合(GEO)数据库中经过筛选比对,选择基因表达谱(GSE53454).使用GEO2R工具筛选出24、48、72 h 3个时间段暴露于白细胞介素(IL)-1β和干扰素(IFN)-γ的人胰岛处理组(暴露组)和非暴露组之间的差异表达基因(DEG).使用DAVID进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析.通过STRING和Cytoscape应用构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络.结果 共鉴定出69个上调的DEG和2个下调的DEG.GO分析结果显示,在生物过程中,DEG在对病毒的防御反应、炎症反应等方面富集;细胞成分中,DEG在细胞外隙、质膜外侧、细胞外区域显著富集;分子功能中,DEG在趋化因子活性、细胞因子活性方面显著富集.KEGG分析结果显示,DEG主要在细胞因子-细胞因子受体相互作用、病毒蛋白与细胞因子和细胞因子受体的相互作用等信号通路中富集.STRING分析结果选出了10个连接度较高的核心基因(STAT1、CXCL10、IRF1、IL6、CXCL9、CCL5、CXCL11、ISG15、CD274、IFIT3),均在暴露于IL-1β和IFN-γ的人胰岛中显著上调.KEGG再富集发现6个基因(STAT1、CXCL10、CXCL9、CXCL11、CCL5、IL6),主要在Toll样受体信号通路中显著富集.结论 STAT1、CXCL10、CXCL9、CXCL11、CCL5、IL6为影响人胰岛存活的关键基因,主要在Toll样受体信号通路中富集,是胰岛保护的重要靶点.