纳米孔靶向测序技术快速检测复杂性尿路感染病原菌的临床价值

目的:探讨纳米孔靶向测序技术(NTS)检测复杂性尿路感染病原菌的临床价值。方法:回顾性分析2020年7月至2021年6月武汉大学人民医院泌尿外科收治的326例复杂性尿路感染患者的临床资料。男224例，女102例。年龄(56.88±14.58)岁。收集抗感染治疗前同一时间尿液样本分别行NTS及尿培养检测，记录检测所耗时间和检测结果。采用 χ2检验、 t检验、Wilcoxon秩和检验进行统计学分析，比较两种检测方法病原菌检出率、检测所耗时间及检出菌种数量的差异。 结果:326例中NTS和尿培养分别检出尿路微生物221例(67.80%)和78例(23.93%)，NTS尿路微生物检出率显著高于尿培养( χ2＝130.25， P<0.01)。NTS和尿培养分别检出病原菌177例(54.29%)和76例(23.31%)，NTS病原菌检出率显著高于尿培养(χ 2＝38.95， P<0.01)。221例中NTS检出1种尿路微生物106例，2种68例，≥3种47例；78例中尿培养检出1种尿路微生物73例，2种5例；NTS检出尿液微生物种类明显多于尿培养( Z＝11.49， P<0.01)。NTS检出1种病原菌114例，2种48例，≥3种15例；尿培养检出1种病原菌71例，2种5例；NTS检出病原菌种类明显多于尿培养(Z＝9.67， P<0.01)。NTS检出尿路微生物的种类显著多于尿培养( Z＝11.49， P<0.01)，其中病原菌种类亦显著多于尿培养( Z＝9.67， P<0.01)。NTS与尿培养检测时长分别为(24.29±2.65)h与(49.28±11.30)h，差异有统计学意义( t ＝39.48， P<0.01)。135例(41.41%)NTS与尿培养结果完全一致；150例(46.01%)NTS提示尿培养未检出的尿路微生物，其中112例(34.36%)为病原菌；27例(8.28%)NTS除检出尿培养提示的病原菌外，还检出更多病原菌。6例(1.84%)治疗后复查NTS可见首要病原菌reads数量值下降，出现定植菌或条件致病菌生长。5例(1.53%)复查尿培养结果验证了入院时NTS检测结果，其中2例(0.61%)入院时NTS可以覆盖后续多次尿培养病原菌。 结论:NTS检测尿路感染病原菌具有快速、灵敏、全面的优势，在尿培养结果尚未报告甚至阴性时，NTS具备一定的临床参考价值，可作为尿培养的有效补充，有利于对患者病情的综合判断。