基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值

姚宇轩,邓正栋, 梅洪亮, 李翔宇, 王剑明

wf(2022)

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摘要
目的 探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值.方法 通过生物信息学方法,利用TCGA、GEO、ICGC数据库探究TRIM29 mRNA表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用.结果 TRIM29在胰腺癌组织中显著上调(P<0.05).TRIM29高表达的胰腺癌患者总生存期(OS)显著低于TRIM29低表达的胰腺癌患者(P<0.05).Meta分析验证了TRIM29上调是胰腺癌患者OS的不利预后因素.TRIM29表达水平与胰腺癌T分期和病理分期密切相关(均P<0.05).TRIM29表达水平是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.19,95%CI=1.03~1.36,P<0.05).列线图分析同样验证了TRIM29的预测能力.GO富集分析结果显示TRIM29可能具有调节细胞外基质结构成分,参与细胞间连接等分子功能;KEGG富集分析结果显示TRIM29可能与粘着斑和PI3K-Akt等信号通路相关.TRIM29甲基化水平和表达量呈负相关(r=-0.71,P<0.01),且TRIM29低甲基化的胰腺癌患者OS和无进展生存期(PFS)显著低于TRIM29高甲基化的胰腺癌患者(均P<0.05).结论 TRIM29在胰腺癌组织中呈现高表达和低甲基化水平,且与胰腺癌患者预后不良密切相关,甲基化调控可能在TRIM29促进胰腺癌的发生发展中具有重要作用.
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关键词
TRIM29
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