苹果茎痘病毒RdRp基因分子变异分析

MA Xiaofang,HONG Ni,JIANG Yingchun, WU Liming, SONG Fang,HE Ligang, WANG Ce, YU Tingting,WANG Zhijing,WANG Guoping

wf（2022）

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摘要

苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,AS-PV)是凹陷病毒属β线性病毒科(Foveavirus,Betaflexiviridae)的典型代表.ASPV基因组是正单链RNA(+ssRNA),全长约9 300个核苷酸,包含5个开放式阅读框(Open reading frames,ORFs),5'端非翻译区(Untranslated region,UTR)和3'UTR.ORF 1编码依赖RNA的RNA聚合酶(RNA dependent RNA polymerase,RdRp),ORF 2～4表达与病毒移动相关的三基因块(triple gene block 1～3,TGB 1～3),ORF 5 编码外壳蛋白(coat protein,CP).有关ASPV CP和TGB基因的分子变异规律已有报道[1],而ASPV RdRp不同分离物分子变异规律尚不明确.本研究采用RT-PCR、进化树和重组分析方法,分析了源于梨的不同分离物ASPV RdRp分子变异情况.

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