基于生物信息学和分子对接分析栀子柏皮汤治疗炎症性肠病的作用机制

GAN Xiao-ruo, JIA Jin-yu,SHI Chen-song, TONG Miao-miao, HUANG Yun, LV Pin,QI Huan-yang

wf(2022)

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摘要
目的 基于生物信息学和分子对接,探讨栀子柏皮汤治疗炎症性肠病(Inflammatory bowel disease,IBD)的主要活性成分及作用机制.方法 通过中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Database and Analysis Platform,TCMSP)和本草组鉴(HERB)数据库筛选"栀子""甘草""黄柏"三味药材的有效成分和作用靶点,构建"中药-成分-靶点"网络图.通过基因表达数据库(GEO)和DisGeNET数据库筛选炎症性肠病的相关基因,并用R软件进行数据分析和可视化.通过String平台构建药物和疾病交集靶点的蛋白互作网络(PPI),并利用Cytoscape的MCODE插件筛选核心靶点.使用DAVID平台对核心靶点进行GO和KEGG富集分析.使用AutoDock将核心靶点与活性成分进行分子对接.结果 栀子柏皮汤与炎症性肠病共同作用的目标靶点有13个,GO富集分析得到相关条目49个,KEGG通路富集得到35条信号通路.结论 初步探究了栀子柏皮汤治疗炎症性肠病的潜在靶点和相关通路,栀子柏皮汤中的槲皮素、小檗碱等活性成分,可能通过作用于STAT3、IL-1β和TNF等靶点,调控以TNF、Jak-STAT及NF-κB为代表的信号通路治疗炎症性肠病.
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关键词
ZhiZi BoPi Decoction,Inflammatory bowel disease,Bioinformatics,Network pharmacology,Molecular docking
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