丹参SmHB12基因生物信息学及表达分析

wf(2022)

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摘要
植物同源异型域-亮氨酸拉链Ⅰ(homeodomain-leucine zipper Ⅰ,HD-Zip Ⅰ)转录因子在响应非生物胁迫方面发挥了重要作用.本研究根据干旱胁迫下丹参(Salvia miltiorrhiiza Bunge)幼苗根转录组数据,克隆获得丹参HB12(SmHB12)基因片段并进行测序验证,其开放阅读框长度603 bp,编码200个氨基酸.蛋白理化性质分析表明蛋白质相对分子量为22.95 kDa,理论等电点为5.42,含有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点.亚细胞定位结果表明SmHB12蛋白定位于细胞核.实时荧光定量PCR结果表明SmHB12基因在不同组织中均有表达,花中表达量最高,其次是茎和叶,根中最低,并受脱落酸(ABA)和聚乙二醇-6000(PEG-6000)胁迫强烈诱导.上述结果为后续开展SmHB12基因的功能研究提供理论依据.
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关键词
SmHB12
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