一株MLB1型星状病毒全基因组序列分析

了解我国MLB1型星状病毒基因组特征,为星状病毒腹泻的防控提供基础数据.使用星状病毒通用引物筛查北京市丰台区2017年72份儿童腹泻监测病例标本;扩增MLB星状病毒全基因组序列,采用在线比对、进化、重组等生物学信息学方法分析MLB1的全基因组序列.从72份标本中检出2份1型星状病毒(2.78％)和1份MLB1型星状病毒(MLB1-FT)(1.39％).MLB1-FT与GenBank已报道的MLB1型星状病毒全基因组相似性为92.51％～98.28％;MLB1-FT的三个ORF区,仅5个位点氨基酸与其他株均不相同.依据其ORF2部分序列的进化分析,MLB1可分为A和B两个组,其中A组可分为a和b亚组,MLB1-FT为A组中的b亚组.未发现MLB1-FT具有重组现象.MLB1-FT具有星状病毒特征性的保守基序,部分保守基序与其他型别星状病毒不一样,为MLB1星状病毒特有.MLB1-FT具备新型星状病毒MLB的典型特征.我国新型星状病毒监测力度较弱,应加强监测.