玉米ALA基因家族的全基因组分析
wf(2022)
Abstract
为了研究氨基磷脂ATP酶(Aminophospholipid ATPase,ALA)基因家族的成员和分类,以及在玉米非生物胁迫下的生长发育与胁迫响应中的功能,基于玉米基因组数据,利用生物信息学的方法鉴定了玉米ALA基因家族成员,并分析了这些家族成员的染色体分布、蛋白质理化性质、系统发育进化关系、启动子顺式作用元件与表达模式.结果表明:玉米中有33个ZmALA基因,分布于10条染色体上;ZmALA编码的蛋白质呈酸性或者碱性,大部分家族成员定位在细胞膜;33个成员中鉴定到了 10个motif,通过构建系统进化树可以将ALA家族成员分为5个簇;顺式作用元件分析发现ZmALA家族成员含有光响应、缺氧、低温、激素响应元件;通过转录组数据分析发现大部分ZmALA家族成员在热胁迫下的叶片中表达量发生显著变化,实时荧光定量PCR分析验证了这些基因参与了植物热胁迫响应.本研究结果为后续开展玉米ALA基因在热胁迫响应中的研究提供了科学依据.
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