云南省2021年手足口病病例8株埃可病毒18型分离株基因特征

目的 分析云南省2021年手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病例埃可病毒18型(Echovirus 18,E18)分离株基因特征.方法 从2021年云南省2个市州HFMD病例粪便标本中分离E18;对VP1区基因进行扩增、测序和拼接,获得全序列;构建E18分离株与GenBank中参考株的系统进化树,分析基因特征.结果 从HFMD病例中获得8株E18分离株,其完整VP1区序列的核苷酸、氨基酸同源性分别为96.75％-99.77％、97.21％-100％;与原型株Metcalf相比的核苷酸、氨基酸同源性分别为77.24％-78.63％、91.99％-93.73％.基于VP1区分型,8株分离株均属于基因型5分支2,且在VP1区存在特有的氨基酸位点变异(T80A、I240V、T274S和H281R).结论 本研究E18分离株属于基因型5,可能在环境中循环了一段时间.需进一步加强HFMD病例E18监测和分子生物学特征研究.