贵州省2019-2021年人源和猪源戊型肝炎病毒基因特征

目的 分析贵州省部分地区人源和猪源戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)流行株基因特征.方法 2019-2021年在贵州省医疗机构收集急性HEV感染者(抗-HEV IgM阳性)血清标本,在屠宰场收集猪胆汁和血清标本,提取HEV核酸,对HEV ORF2区基因进行扩增和测序,构建系统进化树,分析基因型、基因亚型及其核苷酸和氨基酸同源性.结果 从450例急性HEV感染者标本和196份猪标本中共获得53条人源和2条猪源HEV序列.人源序列的核苷酸和氨基酸同源性分别为81.39％-100％和95.92％-100％,猪源序列分别为87.40％和100％;人源和猪源HEV均与HEV基因4型参考株的核苷酸同源性最高,分别为89.93％和89.83％.55条HEV序列位于系统进化树的3个分支,其中24条与4b亚型、20条与4a亚型、11条与4d亚型参考株处于同一分支,且核苷酸同源性最高,分别为95.54％、93.10％、95.72％.2条人源序列各发生1个位点的氨基酸替换.结论 2019-2021年贵州省部分地区人群和猪群中HEV优势流行株为基因4型,包括4b、4a和4d亚型,氨基酸序列相对保守;可能存在跨种传播.