Bta-miR-19b在LPS诱导的奶牛(Bos taurus)乳腺上皮细胞中的表达及其生物信息学分析

为了分析奶牛(Bos taurus)miR-19b(Bta-miR-19b)在乳腺上皮细胞炎症反应中的表达及潜在调节机制,本研究利用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)检测了 Bta-miR-19b在脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)诱导奶牛乳腺上皮细胞第0、3、6、12、24 h的表达水平,并采用生物信息技术对Bta-miR-19b进行了功能分析.结果表明,与对照组0h相比,Bta-miR-19b在LPS诱导后第3、6、12、24 h的表达水平均极显著下调(P＜0.01),且在12 h的表达水平最低.生物信息学分析发现Bta-miR-19b的成熟体序列在多种哺乳动物间高度保守;Bta-miR-19b的85个候选靶基因显著富集在内皮细胞凋亡过程和子宫内胚胎发育等生物学过程,并参与FoxO信号通路、mTOR信号通路和PI3K-AKT等信号通路(P＜0.05);蛋白质互作网络分析显示,磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase,catalytic subunit alpha,PIK3CA)基因与磷酸酶和张力蛋白同源物(phosphatase and tensin homolog,PTEN)基因是Bta-miR-19b的核心候选靶基因.结果提示,Bta-miR-19b可能通过PIK3CA和PTEN基因介导的PI3K/AKT/NF-кB或PI3K/AKT/mTOR信号传导途径调控LPS诱导的奶牛乳腺上皮细胞炎症反应,可为奶牛乳腺炎的分子调节机制解析奠定基础.