基于宏基因组学技术研究生态繁育冬虫夏草对大鼠肠道菌群的影响

目的:基于宏基因组学技术研究生态繁育冬虫夏草(CCs)对大鼠肠道菌群的影响,尝试用组学技术表征冬虫夏草的功效.方法:将雄性SD大鼠随机分为给药组和空白组,分别灌胃给与虫草粉末和生理盐水14 d后,收集其粪便进行宏基因测序.结果:给药组肠道菌群明显改变,菌群多样性指数提高.肠道菌群物种组成及线性判别分析(LEfSe)显示,CCs能够调节门、纲、目、种各个层级的菌群丰度,显著降低放线菌门(Actinobacteria)、丹毒丝菌纲(Erysipelotrichia)、红蝽菌纲(Coriobacteri?ia)、丹毒丝菌目(Erysipelotrichales)的相对丰度(P<0.05),显著增加大鼠鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus)的相对丰度(P<0.05).京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能注释提示,两组肠道菌群的功能主要集中在新陈代谢相关的氨基酸代谢、碳水化合物代谢通路;给药组调节了"抗肿瘤(antineoplastic)"和"免疫系统(immune system)"相关的功能通路.结论:CCs能够促进益生菌生长,虫草多糖可能会对肠道菌群产生影响,KEGG显示CCs可能通过调节肠道菌群增强抗肿瘤和免疫调节能力.