基于网络药理学方法研究"黄芪-人参"药对治疗胃癌的作用机制
wf(2022)
Abstract
目的:应用网络药理学方法探讨"黄芪-人参"药对治疗胃癌的作用机制.方法:依托中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索"黄芪-人参"中药化学成分、作用靶点,并通过人类基因数据库(the human gene da-tabase,GeneCards)、比较毒物基因组学数据库(CTD)得到胃癌相关基因,探寻"黄芪-人参"药对中与胃癌相关的作用靶点,建立"化合物-靶点"网络图;依据STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用网络(protein-protein interactions,PPI),筛选出核心靶点,提交到生物信息注释数据库(DAVID)进行基因富集分析,获得基因本体论功能富集分析(gene ontology,GO)及KEGG富集分析(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)注释结果.结果:依据筛选条件[口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、药物相似性(drug-likeness,DL)≥0.18)]共得到41个活性成分,其中黄芪20个,人参22个,药物潜在靶点384个.2个疾病数据库中共收集到200个疾病靶点.通过韦恩图筛选出黄芪-人参作用于胃癌的22个关键靶点,通过degree值做PPI网络进行功能分析,共选出5个关键靶点,主要涉及丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶、丝裂原活化蛋白激酶8、胱天蛋白酶3、前列腺素内过氧化物合成酶2、胱天蛋白酶9等.GO生物过程分析以P<0.01通过靶基因筛选出排名靠前的条目,主要包括血管平滑肌增殖、凋亡过程、对细胞因子的反应、染色质结合、DNA结合、蛋白质同聚活性等.KEGG富集结果筛选出与胃癌相关的前20条信号通路,主要涉及神经营养蛋白信号通路、Toll样受体信号通路、肿瘤坏死因子等.结论:"黄芪-人参"药对通过调控致癌物质代谢、免疫耐药、炎症反应,对癌症的发生、转移及耐药发挥防治胃癌的作用.
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