基于细胞周期蛋白相关基因的骨肉瘤预后模型的构建与评价
wf（2022）
摘要
目的:通过生物信息学方法筛选骨肉瘤细胞周期蛋白相关基因构建预后模型,探讨其对骨肉瘤患者预后的预测能力及与肿瘤免疫浸润的相关性.方法:利用UCSC Xena数据库下载88个骨肉瘤患者基因表达数据及临床信息,从GTEx数据库下载396个正常肌肉组织基因表达数据,将两者合并、去批次效应后取差异基因,从GeneCards数据库获取与细胞周期蛋白相关的基因,将差异基因与骨肉瘤细胞周期蛋白相关基因取交集得到267个候选基因.ESTIMATE和TIMER算法用于免疫浸润分析.结果:经单因素Cox回归分析获得15个与预后相关的基因,经过LASSO-Cox回归分析构建由12个关键基因组成的预后风险评估模型,模型表现出有效区分高、低风险组患者的能力,并且结果提示高、低风险组的肿瘤免疫浸润表现具有明显差别.结论:基于细胞周期蛋白相关基因构建的预后模型对骨肉瘤患者预后的预测能力较好.
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