油菜与紫苏FAD3基因的序列比较分析

以甘蓝型油菜'滇早油16号'[亚麻酸(α-Linolenic acid,ALA)含量为9.7％]和紫苏'滇紫1号'(亚麻酸含量为64.7％)为材料,通过RT-PCR克隆开花后40 d种子的FAD3基因,分别获得了 7条油菜和5条紫苏FAD3基因的CDS.油菜序列间存在着碱基缺失和碱基替换,其序列一致性为96.39％;紫苏序列间存在着碱基替换,无碱基缺失,其序列一致性为99.57％;但油菜和紫苏间的序列一致性仅为81.72％.油菜FAD3蛋白的等电点在7.42～7.85,偏中性,其氨基酸序列的一致性为97.00％;紫苏FAD3蛋白的等电点为8.93,偏碱性,其氨基酸序列的一致性为99.87％;但油菜和紫苏间的氨基酸序列一致性仅为83.33％.油菜和紫苏的FAD3蛋白均有3个跨膜区和3个组氨酸富集保守区.在组氨酸富集保守区有16个氨基酸改变,其中6个氨基酸发生性质改变.在第3组氨酸富集保守区和第3跨膜区,油菜与紫苏FAD3蛋白的二级结构存在较大的差异.这些结果暗示了油菜FAD3酶的比活力和紫苏的可能不同,是引起其种子ALA含量不同的原因之一,为进一步提高油菜亚麻酸含量提供理论基础.