eDNA宏条形码监测沉积物原生生物群落多样性

Xue Qiwen,Yang Jianghua, Zhang Lijuan,Zhang Xiaowei,Lei Chunsheng

Asian Journal of Ecotoxicology（2022）

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Abstract

原生生物个体小、繁殖快,对污染物敏感,是沉积物环境污染重要指示类群.传统基于形态学的方法难以快速准确地反映沉积物中原生生物的群落组成和物种多样性,严重制约了其在水生态评估中的应用.本研究采用环境DNA宏条形码方法,基于真核18S rRNA基因片段分析了太湖流域沉积物原生生物的群落结构及其时空差异,筛选了可用于太湖流域沉积物生态评估的原生生物指标,建立了基于原生生物的水生态评估方法.结果显示,利用环境DNA技术在太湖流域沉积物共检出原生生物群落有2468个分类单元(OTU),属于13门44纲,至少在2个平行样本出现的OTU占总OTU的84.25％,春季(3月)与秋季(8月)原生生物群落组成差异明显.评价结果表明,目前太湖流域原生生物群落完整性整体处于亚健康和一般水平.

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