钾通道四聚结构域17在肾透明细胞癌中的表达及其临床意义

目的 利用生物信息学分析钾通道四聚结构域17(KCTD17)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及临床意义,并探究相关机制.方法 结合癌症基因图谱数据库,分析KCTD17在ccRCC肿瘤和癌旁组织中转录水平差异及其与临床病理特征相关性.通过Kaplan-Meier和Cox回归分析KCTD17表达与ccRCC总体生存期和无进展生存期的临床关系.利用通路分析KCTD17在ccRCC中参与的机制.CIBERSORT数据库分析KCTD17表达与免疫细胞浸润及免疫检查点基因的相关性.结果 KCTD17在ccRCC癌组织中表达升高(癌比癌旁组织为3.08±0.89比2.49±0.87,t=4.034,P＜0.001),其表达与临床分期(Ⅲ期 比 I 期为 3.220±0.888 比 2.998±0.897,t=2.298,P=0.01,Ⅲ期 比 Ⅱ期为 3.220±0.888 比 2.724±1.348,t=2.539,P＜0.05,Ⅳ期 比 I 期为3.402±0.832 比 2.998±0.897,t=3.755,P=0.001,Ⅳ期 比 Ⅱ 期为 3.402±0.832 比 2.724±1.348,t=3.371,P＜0.01)、分级(G4 比 G1 为 3.678±0.67 比 3.237±0.454,t=3.058,P=0.007;G4 比 G2 为 3.678±0.67 比 2.922±0.943,t=7.572,P＜0.001;G4 比 G3 为 3.678±0.67 比 3.102±0.920,t=5.716,P＜0.001)、肿瘤分期(T3期 比 T1 期为 3.283±0.857 比 3.008±0.896,t=3.271,P＜0.001;T3 期 比 T2 期为 3.283±0.857 比 2.767±1.264,t=3.127,P＜0.01;T4 期 比 T1 期为3.925±0.997 比 3.008±0.896,t=2.865,P＜0.05;T4 期比 T2 期为 3.925±0.997 比 2.767±1.264,t=3.308,P＜0.01)、淋巴结转移(转移比非转移为 4.018±0.593 比 3.054±1.027,t=5.777,P＜0.001)和远处转移(转移 比 非转移为 3.375±0.791 比 3.027±0.979,t=3.408,P＜0.01)显著正相关.KCTD17高表达患者总体生存率(P＜0.01)和无进展生存率(P＜0.001)均低于低表达患者,且KCTD17是ccRCC患者总体生存期[风险比(HR):1.408,95％可信区间(CI):1.162～1.705,P＜0.001]和无进展生存期(HR:1.609,95％CI:1.308～1.980,P＜0.001)的独立预测因素.通路分析显示KCTD17可能通过上皮间质转化(P＜0.001)、凝血(P＜0.001)、缺氧(P＜0.001)、补体(P＜0.001)、白细胞介素(IL)-6/酪氨酸激酶(JAK)/信号转导与转录激活因子3(STAT3)信号(P＜0.005)及脂肪酸代谢(P＜0.05)及肿瘤免疫微环境相关通路[免疫反应调节(P＜0.001)、淋巴细胞活化正向调节(P＜0.001)、B细胞受体信号调节(P＜0.001)、免疫效应过程调节(P＜0.001)、补体激活调节(P＜0.001)、经典补体激活途径(P＜0.001)和免疫球蛋白受体结合(P＜0.001)]参与ccRCC发生发展及导致不良预后.KCTD17高表达组的浆细胞(高表达组比低表达组为0.029±0.020 比 0.026±0.025,t=1.702,P＜0.05)、CD8 T 细胞(高表达组 比 低表达组为 0.116±0.102 比0.085±0.082,t=3.806,P＜0.001)、休眠记忆CD4 T细胞(高表达组 比 低表达组为0.079±0.059比0.063±0.048,t=3.357,P=0.001)、激活记忆CD4 T细胞(高表达组 比 低表达组为0.006±0.002比0.004±0.003,t=9.023,P＜0.001)、滤泡辅助性T细胞(高表达组 比低表达组为0.019±0.014比0.015±0.013,t=3.409,P＜0.001)、调节性T细胞(高表达组 比 低表达组为0.012±0.010比0.009±0.006,t=4.191,P＜0.001)、休眠NK细胞(高表达组 比 低表达组为0.013±0.004比0.010±0.002,t=10.930,P＜0.05)、激活NK细胞(高表达组 比 低表达组为0.033±0.025比0.027±0.020,t=2.732,P＜0.05)、MO巨噬细胞(高表达组 比 低表达组为0.023±0.012比0.016±0.010,t=7.297,P＜0.001)、M1巨噬细胞(高表达组 比低表达组为0.040±0.029比0.030±0.022,t=4.742,P＜0.001)、M2巨噬细胞的浸润(高表达组 比低表达组为0.207±0.100比0.155±0.082,t=6.542,P＜0.001)丰度升高.KCTD17表达水平与常见免疫检查点基因PD1[相关系数(cor)=0.404,P＜0.001]、TIGIT(cor=0.403,P＜0.001)、CTLA4(cor=0.398,P＜0.001)、LAG3(cor=0.397,P＜0.001)、MIF(cor=0.169,P＜0.001)显著正相关.结论 KCTD17 在 ccRCC中高表达并提示预后不佳,可能与肿瘤微环境免疫抑制相关.