Chrome Extension
WeChat Mini Program
Use on ChatGLM

盐碱地白刺不同部位微生物群落高通量分析

Xinjiang Agricultural Sciences(2022)

Cited 0|Views0
No score
Abstract
[目的]研究新疆盐碱环境中耐盐植物白刺的根际土壤和叶片内生微生物群落的结构丰富度和多样性.[方法]运用Novaseq测序平台对白刺根际土壤和叶片进行16SrDNA-V4区和ITS1区测序.经FLASH进行拼接,经过Qiim过滤叶绿体和线粒体序列,得到的序列在97%的序列相似性水平上聚类成为操作分类单元(OTUs).对序列数据进行生物信息学分析,评价物种的Chao1指数、shannon指数以及Alpha多样性.[结果]白刺根际土壤细菌优势菌群为放线菌门(Actinobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、芽单胞菌门(Gem-matimonadetes);真菌优势菌群为子囊菌门(Ascomycota).叶片内生细菌优势菌群为蓝细菌门(Cyanobacteria)和放线菌门(Actinobacteria);真菌优势菌群为子囊菌门(Ascomycota),白刺不同部位的微生物菌群数量和多样性有显著差异(P<0.05),白刺各样地之间微生物群落构成差异明显.[结论]白刺不同部位微生物群落的丰富度和多样性分布.
More
AI Read Science
Must-Reading Tree
Example
Generate MRT to find the research sequence of this paper
Chat Paper
Summary is being generated by the instructions you defined