新疆部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况调查及基因多态性分析

目的 了解新疆维吾尔自治区(简称新疆)部分地区牛、羊细粒棘球蚴感染情况和基因多态性,为该地区细粒棘球蚴病的防治提供数据参考.方法 于2020-2021年从伊宁市、阿勒泰市、塔城市、昭苏县、特克斯县、额敏县、博乐市的定点屠宰场采集屠宰后牛、羊的肝脏和肺脏,通过肉眼观察与触摸初步判定感染情况,采集疑似细粒棘球蚴包囊并提取DNA,PCR扩增细粒棘球绦虫细胞色素氧化酶1(cox1)基因并测序.从GenBank中下载细粒棘球绦虫cox1基因G1、G3、G4、G5、G6型序列,与测定的序列行BLAST比对.利用MEGA 7.0软件用邻接法构建系统进化树,用Popart软件构建cox1基因单倍型网络图,用DnaSPv5软件分析cox1基因多态性位点.使用SPSS17.0软件进行统计学分析,对不同地区牛、羊及不同脏器感染率的比较采用x2检验.结果 新疆7个县(市)共调查4 977头(只)牛、羊(牛563头、羊4 414只),采集到疑似细粒棘球蚴包囊141份,其中121份扩增出850 bp的条带并测序成功.牛、羊总感染率为2.07％(103/4 977),其中博乐市牛、羊的感染率最高(6.50％,32/492),与伊宁市(1.80％,38/2 108)、塔城市(1.14％,9/790)、特克斯县(1.06％,2/189)、额敏县(0.72％,7/970)相比,感染率差异有统计学意义(x2=49.873、33.682、8.762、28.666,均P＜0.05).牛、羊的感染率分别为3.02％(17/563)、1.95％(86/4 414),两者差异有统计学意义 a2=14.296,P＜0.05).共采集羊肝、肺包囊101份,其中肝包囊占42.57％(43/101),肺包囊占27.72％(28/101),肝、肺合并感染包囊占29.70％(30/101).共采集牛肝、肺包囊20份,其中肝包囊占25.00％(5/20),肺包囊占45.00％(9/20),肝、肺合并感染包囊占30.00％(6/20).BLAST比对结果显示,121条序列中120条(99.2％)与细粒棘球绦虫G1基因型序列-(MN886258.1、MG280957.1、KX020359.1和MG672143.1)的同源性为98％～100％,在系统进化树上聚为一支;1条(0.8％)与G3基因型序列(MG682532.1)的同源性为100％,在系统进化树上聚为一支.单倍型分析结果显示,cox1基因序列共有18个单倍型,Hap 1～Hap 17为G1型,Hap 18为G3型,其中Hap 1为最大的单倍型群体;18个单倍型间共有20个变异位点.序列比对结果显示,121条序列中有52条出现了碱基的转换和颠换.结论 新疆7个县(市)牛、羊细粒棘球蚴感染率存在明显差异,感染细粒棘球蚴的基因型为G1(99.2％)、G3(0.8％),有18个单倍型,Hap 1为主要致病单倍型.