野生鸟类分离的多重耐药肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)耐药基因分子进化特征研究

[目的]调查野生鸟类携带菌的耐药状况,探索其在细菌耐药性传播过程中的作用.[方法]从野生鸟类石鸡、绯胸鹦鹉、太阳锥尾鹦鹉和黑领椋鸟的新鲜粪便分离4株Klebsiella pneumoniae,采用微量肉汤稀释法评估其多重耐药表型,并利用全基因组测序技术和细菌全因组关联分析、比较基因组学方法对分离株进行分子溯源,系统解析其携带的多重耐药质粒或基因与其宿主、同源质粒间的关联.[结果]4株肺炎克雷伯菌的耐药谱各不相同,来自石鸡样本的分离株S90-2对9种药物耐受,绯胸鹦鹉样本分离株S141对3种药物耐受,太阳锥尾鹦鹉分离株M911-1仅耐受氨苄西林,黑领椋鸟的样本分离株S130-1对所使用的14种药物完全敏感.S90-2 属于 ST629 型,携带 blaCTX-M-14﹑ fosA6﹑ aac(3)-Iid 和 blasHv-ii 为主的 30 个耐药基因和携带1个耐药性质粒pS90-2.3(IncR型).S141属于ST1662型,携带fosA5、l)laSHV-217等27个耐药基因,1 个质粒 pS141.1[IncFIB(K)(pCAV1099-114)/repB 型]仅携带耐药基因 adeF.M911-1为新ST类型,携带blasHv-1、fosA6等共计27个耐药基因,其质粒pM911-1.1携带了 3个耐药基因.S130-1属于ST3753型,携带blaSHv-11﹑ fosA6等27个耐药基因,pS130-1[IncFIB(K)型]则仅携带一个耐药基因tet(A).质粒比对表明,质粒pS90-2.3携带的耐药基因片段源自不同的肠杆菌科菌株染色体或质粒.pS90-2.3的同源质粒主要来自人类宿主菌,且主要在中国分布,这些质粒主要细菌宿主为K.pneumoniae和Escherichia coli,且ST11型K.pneumoniae分离株为重要宿主菌.[结论]本研究中来自野生鸟类的多重耐药K.pneumoniae,其耐药基因主要来自质粒,质粒耐药基因主要由转座子、插入序列、整合子和前噬菌体等可移动元件介导,这些多重耐药质粒与人类的宿主菌密切相关.