hsa-miR-200 c-3 p的靶基因预测及生物信息学分析

目的:采用生物信息学方法对hsa-miR-200c-3p进行靶基因预测及功能分析,为进一步研究其在肿瘤中的作用和发生机制提供思路.方法:分析miR-200c-3p在不同物种间的保守性及hsa-miR-200c-3p在不同器官和疾病中的表达情况;miRDB和Target Scan预测hsa-miR-200c-3p靶基因,取其交集,合并已经实验证实的靶基因.采用DAVID 6.8数据库对基因集合进行GO功能和KEGG通路富集分析.结果:miR-200c-3p序列在物种间高度保守.hsa-miR-200c-3p在膀胱、胃肠道、脑、四肢、肺、前列腺等组织中表达丰度较高;与正常组织相比,在膀胱癌、卵巢癌、肺癌、前列腺癌等疾病中表达水平较高.包括已被实验证实的靶基因,共得到79个候选基因,主要参与调控RNA聚合酶Ⅱ启动子转录、基因表达、细胞增殖、信号转导等生物学过程,涉及前列腺癌、小细胞肺癌、胰腺癌、肾癌等疾病相关通路,以及PI3K-Akt、Ras等肿瘤相关信号通路.结论:hsa-miR-200c-3p功能广泛,参与人类生命活动和疾病过程,与癌症的发生、发展密切相关.