基于生物信息学分析ECT2基因在乳腺癌中的表达及临床意义

目的 基于生物信息学数据库分析上皮细胞转化序列2(ECT2)基因在乳腺癌中的表达及意义.方法 利用cBioPortal网站工具分析癌症基因组图谱(TCGA)数据库乳腺癌差异表达基因,人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析ECT2蛋白在乳腺正常组织及乳腺癌组织中的表达,UALCAN分析CPTAC蛋白组学数据库和TCGA数据库中ECT2表达与临床病理参数的关系,GEPIA2分析TCGA数据库中ECT2表达与乳腺癌生存期的关系.结果 cBioPortal分析显示乳腺癌差异表达基因中高表达1445个,选择前20个差异最显著的基因筛选出ECT2基因,其改变以扩增为主,获得次之,浸润性导管癌中扩增和获得频率最高;UALCAN分析基因热图同样显示ECT2在乳腺癌中过表达,其中在三阴性乳腺癌中表达较高;HPA数据库分析显示ECT2在正常组织及乳腺癌中均有表达,表达量居中;UALCAN分析显示,ECT2在浸润性导管癌中表达增高,在三阴性乳腺癌中呈高表达,并且与肿瘤分期、淋巴结转移、年龄分布及绝经期前后均有关(P<0.001);GEPIA2分析显示ECT2表达与乳腺癌总生存期及无病生存期均无相关性(P>0.05),但经过log-rank统计检验去除混杂因素后ECT2基因高表达患者总生存期及无病生存期均短于低表达患者.结论 基于多数据多组学高通量分析结果,推测ECT2在乳腺癌的发生发展过程中具有重要作用,可能是乳腺癌预后判断的有效指标及乳腺癌治疗的新靶点.