SOCS基因家族在肝细胞癌中的表达及生物信息学分析

目的 基于高通量生物信息学方法系统分析细胞因子信号抑制物(suppressor of cytokine signaling,SOCS)基因家族在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)发生、发展中的作用机制.方法 使用Oncomine、UNLCAN、cBioPortal、Kaplan-Meier plotter、David等多个在线数据库对SOCS家族分子在肝癌细胞中的表达差异、临床病理特征、生存分析、基因突变、生物学功能方面进行综合分析.String在线数据库用于构建SOCS家族基因的蛋白质-蛋白质相互作用网络.结果 大部分SOCS家族基因在HCC中存在表达差异,SOCS5和SOCS7表达显著上调(P<0.05),而SOCS2、SOCS3、SOCS6、CISH表达下调(P<0.05).该家族基因SOCS1、SOCS2、SOCS4、SOCS5、SOCS7、SOCS8与预后相关(P<0.05).SOCSs家族成员在HCC患者中的基因改变形式主要包括扩增、突变和多重基因等类型.在HCC与SOCS家族相关的生物学过程主要富集在Jak-STAT、炎症反应等方面.结论 SOCS基因家族大部分成员在HCC中差异表达,可能是治疗肝细胞癌潜在的新靶点.