基于nrDNA和cpDNA序列的甘肃省4种肉苁蓉种质资源分子鉴定

目的 筛选能够准确鉴定甘肃省不同肉苁蓉种质的序列,探究甘肃省肉苁蓉种质资源遗传关系.方法 利用筛选出的4对引物(ITS2F-ITS3R、CD1F-CD1R、matK3F-matK1R和rbcL1F-rbcL724R)对甘肃省肉苁蓉、沙苁蓉、盐生肉苁蓉和兰州肉苁蓉4种共27份肉苁蓉样品基因组序列进行扩增测序,分析样品的序列特征、核苷酸多态性、单倍型多样性,构建邻接法(NJ)聚类树,从nrDNA和cpDNA两方面进行遗传变异研究.结果 cpDNA合并序列GC含量比nrDNA合并序列低,为34.6％;matK序列的变异位点明显高于ITS、CD及rbcL序列,共检测到481个多态性变异位点;两组合并序列单倍型多样性值均大于0.5,多样性程度较高;NJ聚类树显示,nrDNA和cpDNA的合并序列联合使用更适用于肉苁蓉不同种质的鉴别;肉苁蓉遗传变异主要来自组内变异,即同一物种不同种质间分化明显,nrDNA和cpDNA组内变异百分比分别为79.32％和76.93％.结论 甘肃省肉苁蓉种质资源遗传多样性较为丰富,nrDNA和cpDNA的合并序列能准确鉴定甘肃省4种肉苁蓉.