MMP7基因非CpG岛DNA甲基化对胶质母细胞瘤预后的评估

目的 本研究以胶质母细胞瘤(GBM)为疾病背景,以促癌基因MMP7为研究对象,以期从个体基因角度揭示非CpG岛DNA甲基化在肿瘤疾病中的意义.方法 利用公共数据库数据,比较MMP7基因非CpG岛DNA甲基化在GBM与非肿瘤脑组织(NTB)中的差异程度,并通过统计分析该基因非CpG岛DNA甲基化水平与基因表达、患者预后、分子亚型及生物学背景的关系.结果 本研究共纳入3组GBM样本及3组NTB样本,分析发现位于MMP7基因非CpG岛区域的CpG位点(cg25511807)在GBM中发生显著的低甲基化改变,而其基因表达水平呈现高表达状态.MMP7在不同分子亚型的甲基化和基因表达也呈现相似的模式.关联分析未发现其CpG位点甲基化水平与基因表达水平呈强相关性.生存分析表明MMP7非CpG岛DNA低甲基化患者总体生存时间(OS)显著短于高甲基化组,多因素Cox回归分析表明MMP7甲基化分组是独立于患者年龄、IDH1突变及MGMT启动子CpG岛甲基化状态的预后因子.生物信息学分析表明MMP7低甲基化的肿瘤样本可能富集肿瘤耐药和血管生成相关的功能基因簇.结论 本研究以MMP7基因非CpG岛DNA甲基化在GBM中改变模式、与基因表达、临床预后及生物学背景的关系为例,从个体基因角度,强调基因非CpG岛区域DNA甲基化在肿瘤疾病中重要价值和临床意义.