棉花陆海渐渗系次级分离群体产量和纤维品质QTL定位

[目的]利用海岛棉渐渗系挖掘与产量和纤维品质性状相关的优异基因/数量性状位点(quantitative traitloci,QTL),为培育高产且纤维品质优异的棉花品种提供有用的信息.[方法]利用优异陆海渐渗系材料MBI9626与高产、适应性广的陆地棉品种中棉所36构建了包含152个单株的BC6F2次级分离群体,以筛选的109个简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记检测亲本和群体的基因型,结合多年多代的表型数据,定位产量和纤维品质性状的QTL.[结果]基因型分析表明,MBI9626中中棉所36背景的比例为94.8％.在BC6F2、BC6F2:3和BC6F2:4群体中共检测到28个与产量、纤维品质性状相关的QTL,分布在6条染色体上.其中:产量相关的QTL有16个,解释2.25％～6.14％的表型变异,包括6个多年多环境稳定的QTL;纤维品质相关的QTL有12个,解释2.49％～12.30％的表型变异,包括2个多年多环境稳定的QTL.新检测到19个QTL,包括多环境稳定的5个.在D3染色体上鉴定到1个包含6个QTL的QTL簇,该区间包含233个基因,通过基因本体(gene ontology,GO)聚类和KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,并结合TM-1的转录组数据,筛选出6个可能与纤维发育相关的基因:GH_D03G1428、GH_D03G1466、GH_D03G1518、GH_D03G1570、GH_D03G1586和GH_D03G1640.[结论]本研究检测到28个与棉花产量、纤维品质相关的QTL,为进一步精细定位、候选基因克隆和分子标记辅助选择奠定基础.