Évaluation des gènes liés au pourcentage de Gleason 4 dans une cohorte diagnostique de biopsies prostatiques

Il est recommandé de rapporter le pourcentage de Gleason 4 (%G4) pour un adénocarcinome de la prostate de Gleason score 7, en raison des implications sur les stratégies de prise en charge. À ce jour, personne n’a étudié les gènes impliqués dans le %G4 en tant que variable continue. L’identification de ces gènes permettrait de comprendre les voies métaboliques impliquées dans l’émergence du Gleason 4. Les patients ont été sélectionnés dans une cohorte diagnostique de biopsies prostatiques ciblées par IRM. Soixante-quatre biopsies sans Gleason 5 ont été incluses et macrodisséquées pour analyse transcriptomique de 2549 gènes associés au cancer. L’identification des gènes a été réalisée par expression différentielle entre deux sous-groupes extrêmes de la cohorte (échantillons avec 0–10 % G4 et 50–100 % G4), et par test de corrélation de Spearman comme approche statistique alternative afin d’analyser l’ensemble des données et considérer le %G4 comme une variable continue. Les valeurs de p ajustées ont été calculées selon Benjamini et Hochberg. Parmi le panel de gènes étudiés, ont été identifiés 22 gènes modérément corrélés avec le %G4. Quatorze d’entre eux ont été identifiés par analyse différentielle (valeur p ajustée < 0,05), et 8 gènes supplémentaires ont été identifiés par test de corrélation de Spearman (ρ > 0,3 ou < −0,3, valeur p ajustée < 0,05). Les voies les plus pertinentes (valeur p ajustée < 0,05), identifiées par analyse de surreprésentation, comprenaient les réponses cellulaires aux stimuli (stress, sénescence), la transduction du signal (NOTCH, NOTCH 1 et 3, NTRK, signalisation médiée par l’ESR, signalisation par l’érythropoïétine), l’organisation de la matrice extracellulaire. Cette étude pilote a pu identifier des voies de signalisation pertinentes avec la littérature et l’agressivité tumorale, confirmant l’importance du %G4 dans l’évaluation de l’agressivité du cancer de la prostate. L’étude plus approfondie de ces voies permettrait d’améliorer le pronostic d’un sous-groupe de cancers de la prostate de score de Gleason 7, un groupe à risque hétérogène.