不同来源粪肠球菌的比较基因组学分析

目的 分析不同来源粪肠球菌全基因组特征及其分子进化规律.方法 对收集的不同来源粪肠球菌进行全基因组序列测序,利用比较基因组学分析粪肠球菌的基因特征、耐药基因和毒力基因携带情况,并以此进行泛基因组和核心基因组分析,构建系统发育树,进行系统进化分析.结果 6株不同来源粪肠球菌染色体全基因组序列全长为2 450 754～2 731 452 bp,共含有2 669～3 085个基因,基因组的平均GC含量为38.0％.粪肠球菌具有开放型泛基因组,而核心基因组为稳定型.不同来源菌株基因组中均含有3～14种耐药基因和8～17种毒力基因.基于核心基因系统进化树分析显示,不同来源的粪肠球菌分子进化均匀分布,相互重叠,无明显聚类趋势.结论 粪肠球菌具有开放型泛基因组,其核心基因为稳定型,不同来源分离菌株进化均匀分布,这些结果为后续揭示粪肠球菌分子遗传进化规律等研究奠定了基础.