玉米矮花叶病毒微滴数字RT-PCR检测方法的建立

Acta Phytophylacica Sinica(2022)

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摘要
为准确检测进境玉米可能携带的玉米矮花叶病毒(maize dwarf mosaic virus,MDMV),基于MDMV外壳蛋白(coat protein,CP)保守基因序列,筛选3对引物和2组探针,并优化退火温度,构建基于微滴数字 RT-PCR(droplet digital reverse transcription-polymerase chain reaction,ddRT-PCR)的MDMV精准检测方法.该方法可特异性检测MDMV,对MDMV CP阳性质粒样品的检测灵敏度可以达到1×103拷贝/μL,对69份进口玉米种子检测,检出5批次玉米种子携带MDMV,而荧光定量RT-qPCR仅检出4批次玉米种子,表明建立的ddRT-PCR相对于RT-qPCR有更高的灵敏度和可靠性,可用于玉米上MDMV的检测鉴定.
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