报春花科3种植物对青藏高原适应性进化的转录组学研究

白粉圆叶报春、柔小粉报春和禾叶点地梅是近缘物种,它们生长在海拔3 800 m以上的青藏高原(QTP),并在恶劣的高海拔环境中生存良好.为探索这3种植物适应高海拔的分子遗传机制,通过高通量RNA测序获得、3个物种的转录组数据,OrthoMCL分析鉴定转录数据中的单拷贝同源基因,并进行选择压力分析和功能鉴定.结果显示:对测序数据进行质控后一共获得145 269 464个有效片段;OrthoMCL分析鉴定了 3个物种中2 151个包含单拷贝基因的同源正交群;选择压力分析表明,有827个同源单拷贝基因受到了显著正向选择;基因功能分类分析发现受到正向选择的109个基因参与了代谢、遗传以及生物学调控和应激反应.本研究表明:基于转录组测序筛选出的候选的同源单拷贝基因功能注释结果显示与DNA损伤修复、次生代谢、能量合成与转换等过程相关,这些同源单拷贝基因在3种植物应对高原低压低氧、强紫外线辐射、稀有资源、强烈的气候波动过程中产生至关重要的作用.