极小种群馨香玉兰特异性单核苷酸多态性位点开发

在馨香玉兰全基因组范围内进行特异性单核苷酸多态性(SNP)位点开发,为馨香玉兰濒危保护以及资源利用提供理论依据.利用以云南省5个野生居群和2个栽培居群共70个个体为材料,进行简化基因组测序技术(SLAF-seq),成功开发了 843 082个用于馨香玉兰SLAF建库的标签,其中多态性SLAF标记有287 843个,通过数据质控,共获得了 180 650个高度一致性的群体SNP位点,利用SNP位点对馨香玉兰居群进行遗传多样性分析,结果显示:馨香玉兰的观测杂合度4为0.269 7,期望杂合度He为0.335 5,Shannon指数为0.506 9,Nei多样性指数为0.355 3.结果表明,利用SLAF-seq技术能够实现全基因组范围内的大量SNP标记位点开发,利用大量的SNP位点解析物种的遗传多样性更具准确性和先进性.