济南市发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒基因组特征分析

目的 分析济南市发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒(Severe fever with thrombocytopenia syndrome bunyavirus,SFTSV)基因组特征.方法 通过参考文献并对引物进行矫正,获得SFTSV全基因组序列.应用DNAstar 7.1、MEGA等软件对基因组序列进行基因位点、遗传进化、同源比对分析,建立L、M、S片段基因系统进化树.结果 成功获得7株济南市SFTSV全基因组序列,每株分离株基因组全长均为11 490 bp,其中L片段6 368 bp,M片段3 378 bp,S片段1744 bp.济南市SFTSV属C基因型C3分支.与湖北、河南及山东省泰安和青岛市基因序列同源性高,呈现出明显地域性特点.核苷酸变异以碱基转(颠)换为主,2018年SFTSV分离株共存在0.03％氨基酸突变位点,2019年存在0.02％氨基酸突变位点,2020年存在0.11％氨基酸突变,2020年较2018、2019年明显增多.结论 利用测序方法测定的济南市SFTSV,其基因组序列分析表明与我国流行的SFTSV相近,氨基酸序列突变有增多趋势,需密切关注其致病力、毒力及传播力的改变.