水稻OsERF091基因的生物信息学及表达模式分析

丁婕,段香波, 包亦含, 闭秀维, 于洋

cnki(2022)

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摘要
AP2/ERF (APETALA2/ethylene responsive factor)超家族是植物中广泛存在,且成员数量众多的一类转录因子,但目前对其功能解析还比较有限。本研究对水稻OsERF091基因进行了克隆和序列分析。结果显示,该基因编码区全长912 bp,编码303个氨基酸,蛋白相对分子质量为31.6 kDa。进一步的生物信息学分析表明,OsERF091是一个不稳定的非分泌型亲水蛋白。OsERF091具有1个保守的AP2结构域,不含跨膜结构,二级结构主要由α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲构成,亚细胞定位预测显示该蛋白定位于细胞核。系统进化分析结果表明,OsERF091与单子叶植物中的同源蛋白亲缘关系较近,而与双子叶植物中的较远。通过分析OsERF091在不同组织/器官中的表达量,发现其主要在幼苗的根以及开花后的稻穗中表达。此外,基因芯片数据显示,OsERF091的表达受多种激素的调控,其中茉莉酸对该基因的诱导表达最为明显,表明其可能在茉莉酸信号通路中发挥重要功能。
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关键词
OsERF091
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