鲁莱黑猪线粒体基因突变鉴别及其与生长和肉质性状的关联分析

本研究旨在搜寻鲁莱黑猪线粒体基因的遗传突变位点,并分析其与背膘厚度、肌内脂肪含量和背最长肌肌肉水分含量的关联程度,从而为鲁莱黑猪的分子标记辅助育种提供新的理论支撑.实验以433头鲁莱黑猪为研究对象,测定统计了该群体的背中线肩部最厚处背膘厚、胸腰椎结合处背膘厚、腰荐椎结合处背膘厚、背最长肌肌肉水分含量和肌内脂肪含量的表型数据.选取4组表型差异较大的个体进行线粒体基因测序,搜寻mtDNA上的突变位点.对上述突变进行有害性预测和保守性分析等生物学信息分析,筛选出最有可能影响生长和肉质性状的突变位点,并在鲁莱黑猪群体中检测基因型,开展与上述测定表型的关联分析.结果表明,在鲁莱黑猪群体中共检测到11个mtDNA突变位点,包含9个基因内突变和2个D-loop区突变.生物信息学分析提示有3个突变位点(mt_9130、mt_9648、mt_13751)可能会影响鲁莱黑猪生长和肉质性状.关联分析结果显示,突变位点mt_9130和mt_9648与肌内脂肪含量极显著关联、与背最长肌肌肉水分含量显著关联;突变位点mt_13751仅与胸腰椎结合处背膘厚极显著关联.本实验结果揭示了在鲁莱黑猪群体中,线粒体基因上的突变与生长和肉质性状存在显著关联,为研究线粒体基因对相关表型的遗传效应提供参考,同时为鲁莱黑猪的育种开发了新的分子标记来源.