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花生HSP 20基因家族鉴定及其表达特性分析

JIANG Huanhuan, ZHANG Jiamin, HE Honghuo, LI Limei, WU Qianying, HUANG Xiao,WANG Tong

Journal of Zhaoqing University（2022）

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Abstract
HSP20是一类小分子热激蛋白,在植物抵御逆境胁迫中发挥重要作用.本研究借助花生基因组数据库,通过隐马尔可夫(Hiddne Markov Model,HMM)搜索野生种花生(Arachis duranensis)和(Arachis ipaensis)蛋白质数据库,鉴定出AdHSP20和AiHSP20基因各27个,基因长度为946～1103 bp,不均匀分布在花生9条染色体上.进化树分析显示,这些基因分为11个亚家族.通过对基因结构和保守序列分析表明该基因家族高度保守.表达分析发现,2个野生种花生中各有5个基因在各组织中高表达,大部分基因在果针入土期开始大量表达,具有组织表达特异性,存在多个激素及逆境胁迫相关的顺式作用元件,预示着该基因家族参与花生逆境胁迫响应.
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Key words
peanut,HSP 20 gene family,bioinformatics,gene expression
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