牦牛SRSF10基因克隆及生物信息学分析

为研究牦牛SRSF10(Serine/argnine-rich splicing factor 10,SRSF10)基因的结构及功能,以美仁牦牛脂肪组织cDNA为模板,克隆牦牛SRSF10基因的编码区(Coding sequence,CDS)序列,并利用基因序列进行生物信息学分析及蛋白理化性质预测.结果表明,美仁牦牛SRSF10基因的CDS区全长789 bp,共编码262个氨基酸;同源性比对发现,牦牛与野牦牛、黄牛之间的SRSF10基因亲缘关系最近(100％),与北极狐最远(97％);牦牛SRSF10蛋白分析显示,SRSF10蛋白内存在2个糖基化位点,1个RRM结构域(74 aa),无跨膜结构域及信号肽区域,其氨基酸等电点11.26,不稳定系数(Ⅱ)101.36,GRAVY=-1.762,预测为稳定的亲水性分泌蛋白;亚细胞定位与核定位预测分析均显示,SRSF10位于细胞核(61.9％),蛋白内共有潜在磷酸化位点63个;SRSF10蛋白高级结构由无规则卷曲(58.02％)、α-螺旋(21.76％)、延伸链(10.69％)和β-转角(9.54％)相互连接而成,主要与同为丝氨酸和富含精氨酸剪接因子、RNA结合蛋白等相关蛋白相互作用.综上所述,SRSF10基因在牦牛脂肪组织中发挥重要作用,该研究结果可为SRSF10基因在牦牛脂肪沉积调控机制的研究提供理论依据,也可为牦牛的遗传育种提供参考.