普通牛CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族基因的生物信息学分析

CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族是具有碱性一亮氨酸拉链结构的一类蛋白家族.为对普通牛CCAAT增强子结合蛋白(C/EBPs)家族基因编码蛋白的结构和功能进行生物信息学探析,本研究运用多个生物信息学分析软件分别对普通牛C/EBPs蛋白的理化性质、亲疏水性、基因结构、保守基序、亚细胞定位、染色体定位等进行了具体分析,构建了不同物种C/EBPs基因家族编码蛋白的系统发育树,并比对多种软件寻找准确的预测工具.通过分析研究发现,普通牛C/EBPs基因家族不同基因所编码蛋白质为亲水性不稳定蛋白,无跨膜结构和信号肽,均为非分泌型蛋白,家族中6个成员都是丝氨酸(Ser)磷酸化位点占比最大;但是普通牛C/EBPs基因家族不同基因所编码的氨基酸数、理论等电点、二级结构、染色体定位、保守基序等却存在一定差异;普通牛C/EBPs基因与牦牛、水牛、瘤牛亲缘关系较近,与鸡的遗传距离最远.这些研究结果为后续对牛C/EBPs家族基因功能的深入研究提供了重要的科学依据和参考,为其他使用软件对基因进行生物信息学分析的研究者提供了借鉴.