全蝽线粒体全基因组序列及其进化分析

全蝽(Walker,1868)隶属于半翅目蝽科,主要为害苹果及其他蔷薇科的果树.为丰富蝽科线粒体基因组学的基本数据,进一步阐明蝽科在蝽总科中的系统发育关系,确定全蝽在蝽科中的分类地位,通过Illumina Miseq平台测序、组装拼接后进行全蝽线粒体基因的注释和分析,结合NCBI数据库中已有数据,基于贝叶斯法(BI)和最大似然法(ML)构建系统发育树.结果表明,全蝽完整的线粒体基因长度为15479 bp,其中包含37个基因(13个蛋白编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因)和一个控制区;全蝽的线粒体基因组的基因顺序与典型的蝽科昆虫一致.经分析,全蝽的A+T总含量为76.18％,远大于G+C含量,表现为明显的AT偏斜;大多数蛋白质编码基因的起始密码子为ATN和TTG,终止密码子为TAN或单个T碱基.除trnA和trnS1外,其他20个tRNA基因的二级结构都能折叠成一个典型的三叶草形状.蛋白编码基因进化速率表明,atp8进化速率最大,进化最快,cox1进化最慢.系统发育树结果显示,全蝽位于蝽科支系且蝽科为单系,这与先前基于形态学或部分分子片段所构建的蝽总科系统发育树结果一致.