非小细胞肺癌组织中SORBS1的临床意义及基因富集分析
Chinese Clinical Oncology(2022)
摘要
目的 探讨非小细胞肺癌(NSCLC)组织中含Sorbin和SH3结构域的蛋白1(SORBS1)的临床意义及其相关的通路和生物学过程.方法 收集本院2016年1月至2019年12月手术切除的126对NSCLC组织和癌旁组织,采用实时定量PCR(qPCR)检测上述组织的SORBS1水平,分层分析组织SORBS1水平与NSCLC临床病理特征关系,结合随访数据进行生存分析并在Kaplan-Meier Plotter数据库中验证其预后意义.采用LinkedOmics数据库对SORBS1的基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)、Panther、Reactome和Wiki通路进行基因集富集分析(GESA).结果 NSCLC组织的SORBS1水平为0.668±0.036,低于癌旁组织的1.712±0.053(P<0.05).分层分析发现组织SORBS1水平与TNM分期、肿瘤大小和分化程度有关(P<0.05),而与性别、年龄、吸烟史、淋巴结转移和病理类型无关(P>0.05).单因素分析显示TNM分期、肿瘤大小、分化程度和组织SORBS1水平与NSCLC患者的OS有关,其中高水平者的中位OS为57.0个月,优于低水平者的35.0个月,差异有统计学意义(HR=3.033,95%CI:1.632~5.637,P<0.001),进一步多因素分析发现组织SORBS1水平是OS的危险因素(HR=2.745,95%CI:1.547~5.162,P=0.024).GO分析结果表明:SORBS1的生物学过程主要富集在的细胞-细胞粘附(GO:0098742)的调控,分子功能的变化主要集中在细胞外基质结构成分(GO:0005201),细胞成分的变化主要集中在细胞外基质(GO:0031012).KEGG、Panther、Reactome和Wiki通路分析结果显示:SORBS1富集于细胞粘附分子(hsa04514)、趋化因子和细胞因子信号通路介导的炎症反应(P00031)、细胞外基质组织(R-HSA-1474244)和软骨内骨化(WP474)相关通路.结论 SORBS1在NSCLC组织中低表达且与不良预后和恶性进展指标有关,且该基因与细胞外基质相关基因表达及相关信号通路调控关系密切,有望成为NCSLC防治的潜在靶点.
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