鸡STAT家族成员鉴定及生物信息学分析

MENG Jie, ZHANG Minghua,YANG Qing,ZHANG Bei,LI Keqiang,ZHANG Chuansheng,GENG Liying,LI Xianglong

Journal of Hebei Normal University of Science & Technology（2022）

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摘要

为了揭示鸡STAT基因家族的生物学功能,利用在线网站和软件对鸡ST4T家族成员进行了鉴定并从理化性质、基因结构、进化关系、染色体定位及二级结构等方面进行了预测和分析.结果表明,鸡STAT基因家族有5个成员,分别命名为ChSTAT1,ChSTAT2,ChSTAT3,ChSTAT4,ChSTAT5A.它们都是酸性、不稳定的亲水蛋白,分布在7,27,33等3条染色体上.根据多物种STAT蛋白进化树分析该基因分为5个亚家族,分别含有1个STAT基因,不同亚家族基因结构、蛋白保守结构域均有差异,分支较近的成员间相似性较强.二级结构预测显示,成员均含有α-螺旋、β-折叠、延伸链和无规则卷曲.鉴定出鸡STAT家族包含5个成员,且成员间结构相对较为保守.

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