基于网络药理学和分子对接探讨补骨脂-肉豆蔻药对治疗肠易激综合征的机制研究

Clinical Journal of Chinese Medicine(2022)

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摘要
目的:补骨脂-肉豆蔻(Psoralea Fructus-Nutmeg,PN)是一组常用中药配伍,在中国已被用于治疗肠易激综合征(Irritable Bowel Syndrome,IBS),本研究旨在探讨PN治疗IBS的潜在机制.方法:通过查阅文献获得PN药对的入血活性成分,上传到Pharm mapper获得潜在目标靶点.采用Cytoscape 3.8.0软件构建化合物-靶点网络.通过DisGeNET、CTD、TTD数据库查找IBS相关基因,利用Cytoscape 3.8.0绘制疾病基因蛋白质-蛋白质相互作用网络.利用DAVID数据库进行了基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.最后,利用AutoDockVina进行了分子对接验证.结果:得到29个药物的活性成分和673个预测的靶基因,得到IBS靶点926个,其中91个与IBS靶点重叠,被认为是潜在的治疗靶点.分析表明,PN的主要靶点丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)1、乙型肝炎、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Threonine-protein Kinase,AKT)1等通过参与FoxO信号通路、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-AKT信号通路等关键通路的反应,改善胃肠黏膜代谢,具有抗炎、抗凋亡、抗氧化和自噬作用,从而缓解了IBS的进展.分子对接结果表明,补骨脂双氢黄酮甲醚、补骨脂异黄酮、小茴香醇A、小茴香醇C、芳香素A2、芳香素B1、芳香素C1、芳香素D1、芳香醇A、补骨脂苷与AKT1、MAPK1、维甲酸受体RXRα(Retinoic Acid Receptor RXR-alpha,RXRA)、雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、糖皮质激素受体(Glucocorticoid Receptor,NR3C1)、MAPK14、热休克蛋白HSP 90-α(Heat Shock Protein HSP 90-alpha,HSP90AA1)、MAPK8、过氧化物酶体增殖物激活受体α(Peroxisome Proliferator-activated Receptor alpha,PPARA)、胰岛素样生长因子Ⅰ(Insulin-like Growth Factor I,IGF1)、一氧化氮合酶(Nitric Oxide Synthase,NOS)2、芳香左旋氨基酸脱羧酶(Aromatic-L-amino-acid Decarboxylase,DDC)具有良好的结合活性.结论:本研究表明,PN可以通过多组分、多目标和多通道联合作用参与IBS的治疗.
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