卵巢癌发生和预后关键基因的生物信息学分析

目的 从TCGA和GTEX数据库分析卵巢癌中的异常表达及与预后相关的基因.方法 利用GEPIA生物信息学分析平台对TCGA数据库和GTEX数据库中卵巢癌与正常组织的关键差异mRNA进行分析.利用R软件进行基因本体富集分析和通路分析,筛选异常表达和与预后相关的基因.结果 共鉴定出差异表达基因7638个,其中上调基因2622个,下调基因5016个.前10位上调的基因包括CLDN3、WFDC2、SLPI、FOLR1、MSLN、CD24、S100A1、CLDN4、LCN2和KRT7,前10位下调的基因包括AL162151.3、STAR、MEG3、DLK1、PROK1、C7、WFIKKN2、DIO3OS、MIR202HG和PLA2G2A.在100个与卵巢癌总生存时间最相关的基因中,PI3、CACNA1C、RPS6KA2、RIPK4、TPT1、SORCS2、CXCL11、CXCL13、SELL、ADAMDEC1的表达存在显著差异.其中PI3和RIPK4 mRNA在卵巢癌中高表达,生存分析提示高表达与预后不良有关.结论 PI3和RIPK4 mRNA在卵巢癌中高表达,与卵巢癌的预后密切相关.它们有可能成为卵巢癌诊断的生物标志物或治疗靶点.