努比亚山羊PDK4基因克隆、序列分析及表达水平研究

为了探究努比亚山羊P DK4基因的脂质代谢途径,试验以40～48周龄努比亚山羊为研究对象,取其心脏、肾脏、肝脏、脾脏、背最长肌及皮下脂肪等组织/器官,分别提取总RNA,将其反转录为cDNA,采用PCR方法扩增PDK4基因片段,利用生物信息学软件分析PDK4基因序列,通过实时荧光定量PCR方法检测努比亚山羊不同组织/器官内PDK4基因的表达情况,同时以都安山羊为对照.结果表明:通过克隆成功获得努比亚山羊PDK4基因的CDS片段,其长度为1224 bp,共编码407个氨基酸残基;PDK4基因核苷酸序列与GenBank中的绵羊、牛、欧亚猪、马、人、小鼠的同源性分别为99.3％、97.6％、93.0％、92.5％、91.0％、85.0％;努比亚山羊P DK4蛋白氨基酸组成中亮氨酸含量较高,占总氨基酸数的10.8％,属于亲水性蛋白;努比亚山羊P DK4蛋白大部分是由α-螺旋和无规则卷曲组成,少部分由延伸链和β-转角组成.此外,努比亚山羊皮下脂肪中P DK4基因相对表达量最高,与其他组织比较差异显著(P<0.05),且心脏中PDK4基因相对表达量最低;努比亚山羊皮下脂肪中的PDK4基因相对表达量显著高于都安山羊(P<0.05).说明PDK4基因可作为研究努比亚山羊脂肪沉积的主要候选基因之一.